ilmoittaa atomissa olevien protonien lukumäärä (elektronien lukumäärä). Samoin sen avulla saadaan selville ytimen varaus (elektronipilven varaus). Ilmoittaa alkuaineen sijainnin alkuaineiden jaksollisessa järjestelmässä. Esimerkiksi hiilen järjestysluku on 6. Se on siis 6. alkuaine jaksollisessa järjestelmässä. Sillä on siis 6 protonia. Koska atomi on neutraali, niin sillä on myös 6 elektronia. Ytimen varausluku on +6 ja elektronipilven varausluku on -6. Katso isotooppi, massaluku, nukleoni ja radioaktiivisuus.